此處的泉水是引自二荒山神社附近湧出的兩處聖泉。其中一處是本殿後方，恆靈山湧出的「藥師靈水」，據說具有治療眼疾的效果。另一處，則是「酒泉」。離當地以西約1 km處的瀧尾神社旁所湧出的泉水。據說用「酒泉」之水釀造的日本酒會非常好喝，全國的釀酒業者每逢春、秋季，就會來此汲取少量的水，作為釀酒用的基底使用。本社入口處擺設的酒樽，就是那些釀酒業者所獻奉的酒。另外，二荒靈泉的水也被視為「回春之泉」，想祈求健康與回春的參拜者，都會來此汲水飲用。
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